AGBT（Advances in Genome Biology and Technology，基因组生物学技术进展大会）作为全球基因组学和测序技术领域规格最高的年度会议之一，近期在美国佛罗里达州奥兰多举行，为世界顶级基因组科学和技术同行提供了进展交流和分享的机会。
本次共239家企业参会，较去年增长了将近48%。单从赞助商来看，此次会议由去年的18家增加到了33家，并涌现出一些此前声量不大的初创企业，如Voltalab、N6等。
头部赞助商的格局更是发生了翻天覆地的变化，去年的金牌赞助商、空间组学知名企业NanoString已于近期宣布破产，而Ultima Genomics从此前的沉潜蓄势一跃成为今年的金牌赞助商。华大智造子公司Complete Genomics在去年赢得了与illumina 3.34亿美元专利纠纷后，在美国市场乘胜追击成为此次AGBT的银牌赞助商。这些变化无不展现出基因产业热度不减、竞争日趋激烈。
作为此次AGBT的金牌赞助商，Ultima Genomics的准备非常充分，重点在于商品化推出UG100，其较此前整合了重要硬件升级以提高仪器的稳定性和可用性。总体看点如下：
Ultima Genomics在此次AGBT大会上公布了合作伙伴以及在UG100上的最新使用数据，知名机构包括the Broad Institute，Regeneron和the New York Genome Center。全新升级的UG100内置24/7自动化，可实现每次运行2组晶圆，最多装载6组晶圆，提供60小时不间断运行，每次运行最多可产出6Tb数据。其测序成本最低可实现1美元/Gb，每个基因组100美元，为市场提供了领先的测序经济效益。这样的参数将使其正式进入超高通量测序领域，成本可以与Complete Genomics此前发布的DNBSEQ T20x2超高通量测序仪相竞争。
Ultima Genomics在此次会议上推出了全新的针对罕见低频SNV检测的ppmSeq技术（paired plus-minus sequencing）以及下游分析与Sentieon合作优化算法提高了碱基统计的准确性及速度，从而实现SNV测序质量达到Q60。从公布的数据上看，升级后的运行成功率从88%提升到了99%，SNV检测的准确性从99.6%提升到了99.8%，INDEL检测的准确性从96.4%提升到99.4%。Ultima Genomics的ppmSeq技术将对需要极高SNV准确性的应用例如肿瘤/cfDNA检测等带来变革。
本次AGBT会议上，Element作为第一银牌赞助商，一口气推出了5款新产品，以下亮点值得特别关注：
业界首个可同时做细胞形态、RNA、蛋白、3D测序一体的多组学平台。搭配使用Teton多组学试剂盒进行细胞培养/采集、固定、透化、组装到可上机的耗材上，样本准备过程约30分，手动时间低于45分钟，上机时间约24小时，一次可做12well（50K个细胞/well）或者1个well（1M个细胞）。使研究人员能够在24小时内从多个角度和时间点分析DNA、RNA、蛋白质、磷酸化蛋白质和细胞形态。
本次会议Element发布了首个可实现Q50的测序试剂盒，预计上半年可售。
除了新的仪器和更高精准度的试剂，Element此次会议为进一步提高可用性和易用性，推出了相应的产品包括更快捷的靶向富集测序流程方案Trinity，可适配市面上95%以上的建库试剂盒更自动化的Cloudbreak Freestyle建库试剂盒，和数据产出更多成本更低的运行模式Expert Mode HD。
空间生物学市场竞争愈发激烈，纯空间组学玩家发声较弱，如NanoString已申请破产保护。10X genomics于1月的JPM会议公布了2023年财报后作为单细胞和空间组学现存的主要玩家，此次AGBT会议上也发布了对于现有产品的性能升级：
1.空间转录组产品Visium升级到Visium HD，分辨率提升至2微米，从而实现单细胞水平的分析，兼容FFPE样本，基因捕获数提升。
2.原位杂交产品Xenium升级，优化了细胞分割，增加了蛋白marker。
3.液滴单细胞产品Chromium升级，基于新的Chromium GEM-X技术可实现在更小体积中生成双倍的凝胶微珠（GEMs），将多细胞率降低了两倍，并增加了通量，基因数显著提升，细胞捕获率提升至80%，并且提出了单样本100美元的路径。
本次AGBT会议上，华大智造子公司Complete Genomics首次成为第三银牌赞助商，并发布了里程碑式的成果，以下亮点值得特别关注：
在本次AGBT大会上，Complete Genomics发布了全新StandardMPS2.0测序试剂，区别于其他厂家，该产品将DNBSEQ平台全线 or MGISEQ-2000）的测序数据质量提高到了Q40（99.99%），相较于Q30的准确度提升了十倍，显著提高了全基因组测序（WGS）以及肿瘤研究中变异检测的精确度、灵敏度，并降低所需的测序数据量，进一步降低了测序成本。首批试用客户们也在现场展示了全新StandardMPS2.0的出色表现。Xpress Genomics公司的首席执行官Christoph Ziegenhain表示StandardMPS2.0的测试数据表现卓越，Q40的到来将有助于拓展单细胞测序的应用。
2.探米乐 登录入口索Q50，全新中高通量测序仪DNBSEQ-G800现已面向美国市场开放试用。
不止步于StandardMPS2.0所带来的测序质量提升，Complete Genomics在基于CoolMPS的测序生化方法推出全新的中高通量测序平台DNBSEQ-G800，新型CoolMPS将能实现最长的读长SE600下平均Q50的测序质量。目前该平台已面向美国市场开放试用，与早期用户共同探索完善Q50测序质量的稳定性。
在此前ASHG会议上Complete Genomics与Nebula Genomics旗下的ProPhase Labs共同宣布DNBSEQ-T10x4已经投入使用并提供全美国乃至全世界成本最低的全基因组测序。此次AGBT会议上，Complete Genomics凭借DNBSEQ-T20X2的超高通量，更将使100美元以下的全基因组测序成为可能；另辟蹊径采用“自发光”技术的便携式测序仪DNBSEQ-E25目前已支持最长PE150读长将进一步拓展应用场景。
准确度提高十倍！华大智造面向全球发布StandardMPS 2.0测序试剂
值得一提的是，近日备受瞩目的“科技届奥斯卡”爱迪生发明奖正式揭晓2024年榜单，华大智造凭借超高通量测序仪DNBSEQ-T20x2入选最佳产品奖“健康、医疗和生物技术”品类。
而华大基因的NIFTY®产品在已有CE准入许可的基础上，获批新增DNBSEQ-G99机型，也为全球出生缺陷防控事业的发展提供强大助力。
作为此次AGBT的铜牌赞助商，Singular此次主要发布原位测序平台G4X（可直接在G4的基础上付费升级），并公布了两组合作伙伴的早期试用数据包括Dana Farber Institute和the Broad Institute。
从公布的参数来看，目前可做300个基因、10-15个蛋白。同一FFPE切片可做直接测序（Direct-Seq™）、蛋白、RNA、H&E。两种芯片规格，4 lanes和2 lanes。一张芯片最大可做10x10mm （4个），最多可做24个样本（4x4）。一共可跑4张芯片。此次升级使空间组学的测序时间缩短（2天湿实验+1天分析时间）并且相较于10x Genomics的Xenium，每周可多30倍的样本量，成本减少一半。
实验室自动化厂商Volta Labs在此次AGBT会议上发布了首款商用仪器Callisto™。区别于市面上液体处理机械臂和模块的组合体，Callisto基于数字流体技术/电润湿技术（electrowetting），通过电场控制来实现精准的流体操纵。
该平台每次运行最多24个反应，支持短读长和长读长测序工作流程的各种预先优化的应用程序，并且支持核酸提取、测序文库自动化。电润湿技术可以显著减少手工时间和试剂用量，耗材只有做隔离的塑料板，所以耗材价格不贵消耗量低。可容纳体积为10-200微升，可做提取和建库。建库目前仅能做PCR-Free和杂交捕获，声称样本之间无污染，但推测PCR会有气溶胶污染。目前已宣布适配已适配illumina、PACBio、ONT、Element平台，并与Watchmaker Genomics 达成合作为其VoltaPrep™文库制备系列产品提供高质量试剂。
本次AGBT会议依旧是精彩不断，Q40高精度的测序质量在此次会议后已成为NGS行业新的进入门槛。不仅局限于NGS，众多厂商在本次会议上争相探索DNA测序仪的多组学应用和更高通量的原位空间测序如Element推出的和Singular的G4X。
相较于新兴测序厂商的活跃表现，传统第一梯队测序厂商illumina，ONT，PacBio在本次AGBT整体发声比较沉闷，投入力度不大。AGBT前后更是紧跟爆出NanaString、Invitae陆续申请破产保护的新闻，而Singular的股价也并没有随着AGBT起死回生，底层核心技术的持续创新依然是硬道理。
总结来说，测序精度不断追求极限（Q40，Q50，Q60），多组学应用甚至一机多用（例如NGS+空间组学应用），生物信息学（深度学习+人工智能）和低成本+易操作的工作流程改进/简化是本次会议众多厂商和客户共同的关注点，也是此次AGBT会议所展现出的测序仪市场新的增长点。
[3] “NGS再次成为AGBT的焦点：Q40成为进入门槛，NGS+多组学被提上日程”
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